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孫思邈是古雍州華原人。七歲上學，每天能誦讀一千多字。二十歲左右時，他喜歡談論莊、老及百家學說，也喜歡佛經。洛陽的總管獨孤信，在見了他之後感嘆地說：“這是一個聖童，只怕他器大識小，很難被任用。”後周宣帝的時候，孫思邈以王室多變故的原因，隱居到太白山裡去了。隋文帝輔政的時候，讓他做國子博士。他稱病不起，沒有接受此職。他常常對周圍親近的人說：“再過五十年，應當有一個聖人出世，那時候我將助他濟世救人。”

五十年後，唐太宗即位，把他召到京城，感嘆他的容貌之年輕，對他說：“看見你，我因此懂得有道的人實在應當受到尊重，羨門、廣成等神仙確實不是虛傳。”太宗要授給他爵位，他堅辭不受。唐顯慶四年，唐高宗召見他，請他做諫議大夫，他又堅辭不受。上元元年時，他托病請求還鄉，高宗特賜良馬給他，並把鄱陽公主的城邑賜給他居住。當時的名士，如宋之問、孟詵、盧照鄰等，都以師弟的禮節待他。

盧照鄰病了，住在孫思邈的住宅裡，當時庭院前有一棵大梨樹，盧照鄰就為那梨樹作了一篇辭賦。他在賦的序言中寫道：“癸酉這年，我因病住在長安光德坊的官捨裡，這裡的老人說，這是鄱陽公主的城邑。從前鄱陽公主未嫁前就死了，所以她的城邑一直荒廢著。當時的一位處士叫孫思邈，他通曉古今，學盡各種數術。他深諳道家的理論，他的學問深入不二，就像當今的維摩詰；至於推算天文曆法，度量乾坤，則可以與洛下閎、安期先生相提並論。他自稱生於開皇辛酉年，已經九十三歲了。到鄉間去打聽他，人們都說他已經幾百歲了。另外，他和人們一起談論起周、齊的事來，清清楚楚，就像親眼見過一樣。以此為參照，就知他不止是一百歲的人了。然而他耳不聾，眼不花，神採奕奕。可以說是古代聰明博達長生不老之人。