贏政做了秦王之后,呂不韋的權勢更大了。而且取得了“仲父”的稱號,他食封大邑万戶,還擁有上万名家僮,財富巨万。同時,為了擴大自己的影響,他又召集很多的門客,讓他們搜集史料,最后輯成了《呂氏春秋》。
趙太后在先前被呂不韋送給子楚之前和呂不韋很要好,現在雖然地位尊貴,但子楚已經死去,守寡時間一長,便和呂不韋又重新走到了一起。此時,秦始皇已經長大,呂不韋也害怕她和太后私通的事被發覺,引來殺身之禍,于是便給趙太后找了個替身,這就是,讓他冒充宦官進宮,在淨身時趙太后買通了執行的人,讓這個假宦官進去供趙太后享樂。
這樣,在秦始皇的身邊有了兩個對他政權构成威脅的人,一個是呂不韋,一個就是嫪毐。在秦王八年,即公元前239年,秦始皇滿二十一歲,依照秦國的舊制,第二年要舉行加冠禮,然后就可以親政了。而呂不韋和嫪毐卻在此時向他示威:呂不韋公開拿出了《呂氏春秋》,嫪毐則依仗趙太后的勢力,私自分土封侯。秦始皇在挑舋面前不動聲色,而是按計划舉行了加冠禮,而嫪毐卻等不及了,他想乘机叛亂,殺掉秦始皇,結果被早有防備的秦始皇平息,自己被捉,最后處以車裂酷刑,誅滅三族。他的同党被誅殺的有二十多人,牽連的多達四千多家。趙太后和嫪毐生的兩個私生子也被殺,趙太后則被軟禁起來,經過群臣的勸說,秦始皇親自把母親接回咸陽。
除掉嫪毐的第二年,秦始皇又免掉了呂不韋的相國,赶出咸陽,讓他到自己的封地洛陽。兩年后,秦始皇為了避免呂不韋和其他國家串通作亂,派人給呂不韋送去絕命書,信中對呂不韋大加斥責:“你對秦國有什么功勞,卻能封土洛陽,食邑十万?你和秦國又有什么親緣,卻得到仲父的稱號?你快給我滾到西蜀去吧!”呂不韋知道自己去也是最后難免一死,干脆服毒自殺了。