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據現有文件及有關人士的回憶錄，當時秘密關押在一個地下室里的，除了沙皇，他的家屬6人，還有皇家醫生，3個從人，包括那個整天背著病太子的水手，共11人。蘇維埃下令槍決所有拘押者，就是說， 還有兩個人的尸體沒有找到.一場以科學來揭開“奇案”的工作就這樣開始了。
科學家首先對這9塊頭骨樣品進行了DNA分析，主要是線粒體DNA。 結果其中5人肯定有親緣關系，3個女性是一男一女的女兒，而另4人與 這5人沒有任何血緣關系，這4人之間也沒有親緣關系。可以相信，這4人為醫生與3個侍從。
當然以上只能証明這9具遺骸的親緣或非親緣關系，還不能最終証明是沙皇一家。
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